Shiki naît le 20 novembre 1970. Sa ville natale, Kasugaï, se situe près de Nagoya dans la préfecture d'Aïchi. Durant son enfance, Satoshi Shiki se passionne très vite pour les mangas et pour le dessin. Il commence donc à dessiner assez tôt. Cependant, il ne prend jamais de cours de dessin. Il apprend par lui-même, à force d'observer les dessins des mangakas professionnels. Il s'exerce énormément et acquiert un réel talent ainsi qu'un style de dessin qui ne demande qu'à s'enrichir et à mûrir. Au lycée, il participe à un club de mangas. Celui-ci lui permet de publier ses premiers mangas sous forme de dojinshi (fanzine).
En 1993 qu'il commence son premier "long" manga : Riot. Cette première oeuvre porte déjà la marque de fabrique de Shiki : un dessin soigné, un scénario fantastique complexe et une galerie de personnages très fouillés. Ce manga connaît d'ailleurs un certain succès au Japon. Malgré cela, Shiki interrompt Riot après son second volume, ce qui marque la fin de sa collaboration avec la Kadokawa.
C'est du côté du fanzinat que l'on retrouve l'auteur en 1997 avec la publication de trois volumes de 69 Stormtroopers of Death, une série qu'il avait auparavant un peu travaillée chez Kadokawa Shoten. C'est également cette année-là qu'il débute la publication de Kamikaze.
Kamikaze est publié par la Kodansha dans le magazine Afternoon. Ce magazine mensuel publie de nombreux titres de qualité qui s'exportent très bien (Eden, Blame !, Ah ! My Goddess, Exaxxion). Kamikaze est un peu l'oeuvre de la maturité pour Shiki qui livre un travail bien plus abouti que Riot. Son dessin a évolué et devient plus personnel. Ce titre bénéficie de dessins somptueux et d'un scénario passionnant et bien ficelé.
Parallèlement à Kamikaze, en 1998, c'est Riot qui renaît. Les deux premiers volumes sont republiés par Shueisha sous le nom Riot of the World. De plus, Shiki commence à dessiner la suite dans le magazine Ultra Jump de la Shueisha. En 2000, un troisième volume voit le jour. Il prolonge l'histoire de Riot, interrompue pendant 6 ans. Ce volume fait le lien entre le style graphique de Satoshi Shiki sur Riot et les progrès affichés dans Kamikaze.
En 2002, Shiki dessine Min Min Mint pour Kodansha. Avec ce nouveau manga, en un volume, le mangaka change radicalement de style. Après des oeuvres sérieuses et plutôt sombres, le voilà qui s'attaque à la comédie. Pendant la publication de Kamikaze, le mangaka a continué sa progression, affinant son style de dessin et maîtrisant de mieux en mieux les techniques de narration du manga. Au début de l'année 2004, l'auteur se consacre à Daphne in the Brilliant Blue. Satoshi Shiki a participé à la conception de cette série animée diffusée depuis début 2004 et il s'occupe de "I" Daphne in the Brilliant Blue, son adaptation en manga, dans le mensuel Young King Ours de la Shonengahosha. Ce travail l'occupe un peu plus d'une année à l'issue de laquelle son manga est interrompu.